Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM3Q96MX0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms