Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC59Q96AG4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC59Q96AG4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms