Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DPF3Q92784 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DPF3Q92784 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DPF3Q92784 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DPF3Q92784 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DPF3Q92784 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DPF3Q92784 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DPF3Q92784 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms