Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf62Q8N4C0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms