Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms