Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF7Q6Q0C0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms