Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01545Q5VT33 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC01545Q5VT33 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC01545Q5VT33 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms