Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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