Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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