Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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