Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 SEC1YDR164C 2175 nt1.88□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 snR62snR62 100 nt1.88□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.88□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 YLR232WYLR232W 348 nt1.88□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 SKI3YPR189W 4299 nt1.88□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 SET3YKR029C 2256 nt1.87□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 IRC20YLR247C 4671 nt1.87□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 YDL073WYDL073W 2955 nt1.87□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 snR190snR190 190 nt1.86□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 STO1YMR125W 2586 nt1.86□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 PMD1YER132C 5262 nt1.86□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 PEP1YBL017C 4740 nt1.85□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 FIG2YCR089W 4830 nt1.84□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 SAC3YDR159W 3906 nt1.84□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 YCS4YLR272C 3531 nt1.84□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 DNF3YMR162C 4971 nt1.83□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.83□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.82□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.82□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 YOR093CYOR093C 4947 nt1.81□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 RAD9YDR217C 3930 nt1.8□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 GEA2YEL022W 4380 nt1.8□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 RPL26BYGR034W 384 nt1.8□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 SMC1YFL008W 3678 nt1.8□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 VPS15YBR097W 4365 nt1.79□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 YLR422WYLR422W 5799 nt1.79□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 WAR1YML076C 2835 nt1.78□□□□□ -2.12
YLL054CQ12244 APL3YBL037W 3078 nt1.77□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 CHS1YNL192W 3396 nt1.77□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 CDC39YCR093W 6327 nt1.77□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 SEC3YER008C 4011 nt1.76□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 RPS26AYGL189C 360 nt1.75□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.75□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 AZF1YOR113W 2745 nt1.75□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 NUP188YML103C 4968 nt1.72□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 NNF2YGR089W 2811 nt1.72□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 SWI4YER111C 3282 nt1.72□□□□□ -2.13
YLL054CQ12244 PIK1YNL267W 3201 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 SSK2YNR031C 4740 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 SPC110YDR356W 2835 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 CFT1YDR301W 4074 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 PET127YOR017W 2403 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 FYV8YGR196C 2454 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 MSH3YCR092C 3057 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 MEC1YBR136W 7107 nt1.66□□□□□ -2.14
YLL054CQ12244 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.65□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 IRA1YBR140C 9279 nt1.65□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 RPM2YML091C 3609 nt1.65□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 UBP3YER151C 2739 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 SEC10YLR166C 2616 nt1.63□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 SXM1YDR395W 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 ROM2YLR371W 4071 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 MYO1YHR023W 5787 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 PRP16YKR086W 3216 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 SEC8YPR055W 3198 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 ORC3YLL004W 1851 nt1.59□□□□□ -2.15
YLL054CQ12244 NUP145YGL092W 3954 nt1.59□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.59□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 BST1YFL025C 3090 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 HKR1YDR420W 5409 nt1.57□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 GLG1YKR058W 1851 nt1.57□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.57□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.57□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 EST2YLR318W 2655 nt1.54□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.53□□□□□ -2.16
YLL054CQ12244 NUP192YJL039C 5052 nt1.52□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 CCH1YGR217W 6120 nt1.52□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 snR47snR47 99 nt1.52□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 BEM3YPL115C 3387 nt1.51□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 BRR2YER172C 6492 nt1.51□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 MSN5YDR335W 3675 nt1.5□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 CAT8YMR280C 4302 nt1.5□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 YSP1YHR155W 3687 nt1.5□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 CDC25YLR310C 4770 nt1.5□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 LAA1YJL207C 6045 nt1.49□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 ULP2YIL031W 3105 nt1.48□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 EST1YLR233C 2100 nt1.48□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.47□□□□□ -2.17
YLL054CQ12244 ANS1YHR126C 480 nt1.46□□□□□ -2.18
YLL054CQ12244 BUD3YCL014W 4911 nt1.45□□□□□ -2.18
YLL054CQ12244 CLU1YMR012W 3834 nt1.45□□□□□ -2.18
YLL054CQ12244 snR69snR69 101 nt1.43□□□□□ -2.18
YLL054CQ12244 snR53snR53 91 nt1.43□□□□□ -2.18
YLL054CQ12244 CSE1YGL238W 2883 nt1.41□□□□□ -2.18
YLL054CQ12244 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.4□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.39□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 snR64snR64 101 nt1.38□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.38□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 NST1YNL091W 3723 nt1.36□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 SPT7YBR081C 3999 nt1.35□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 YGR130CYGR130C 2451 nt1.34□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.34□□□□□ -2.19
YLL054CQ12244 RKR1YMR247C 4689 nt1.33□□□□□ -2.2
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