Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSK3BP49841 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms