Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC34P49427 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC34P49427 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC34P49427 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC34P49427 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms