Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms