Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL3P19876 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL3P19876 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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