Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
V9GYQ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
V9GYQ6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
V9GYQ6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms