Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAN1Q9Y2M0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms