Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms