Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDFIP1Q9BT67 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms