Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms