Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MICAQ29983 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms