Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRADDQ15628 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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