Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN1Q14457 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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