Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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