Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms