Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TP53BP1Q12888 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms