Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTBP60709 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTBP60709 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBP60709 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBP60709 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBP60709 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBP60709 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBP60709 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBP60709 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms