Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1P56182 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1P56182 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1P56182 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1P56182 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP1P56182 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP1P56182 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP1P56182 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP1P56182 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP1P56182 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1P56182 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms