Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMA4P25789 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms