Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGS1P23219 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms