Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCP20941 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCP20941 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCP20941 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDCP20941 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCP20941 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCP20941 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms