Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSP16219 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSP16219 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSP16219 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSP16219 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSP16219 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACADSP16219 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
ACADSP16219 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACADSP16219 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACADSP16219 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACADSP16219 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms