Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TFAP2AP05549 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TFAP2AP05549 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms