Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPA1O75762 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms