Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C1D1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C1D1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C1D1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C1D1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C1D1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C1D1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C1D1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C1D1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C1D1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C1D1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C1D1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C1D1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C1D1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C1D1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C1D1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C1D1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms