Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC026356.1-201ENST00000622688 1357 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC100771.2-201ENST00000525833 1350 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms