Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms