Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAXBP1Q9Y5B6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms