Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERGIC3Q9Y282 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERGIC3Q9Y282 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERGIC3Q9Y282 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERGIC3Q9Y282 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms