Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEFF2Q9UIK5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms