Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF214Q8ND24 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF214Q8ND24 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF214Q8ND24 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF214Q8ND24 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF214Q8ND24 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF214Q8ND24 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms