Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms