Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms