Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEXMIFQ5QGS0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEXMIFQ5QGS0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms