Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEACAM16Q2WEN9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms