Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms