Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-202ENST00000553656 550 ntTSL 413.49□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 EML2-210ENST00000587484 219 ntTSL 313.46□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.261e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-211ENST00000458246 3218 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-205ENST00000418926 546 ntTSL 413.05□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-210ENST00000555810 767 ntTSL 313□□□□□ -0.331e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEH1L-204ENST00000587761 863 ntTSL 512.88□□□□□ -0.351e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 HCN3-204ENST00000496230 3245 ntTSL 212.54□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-218ENST00000491103 871 ntTSL 512.5□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 IFRD2-203ENST00000426499 664 ntTSL 512.48□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FKBP10-208ENST00000585664 598 ntTSL 312.33□□□□□ -0.441e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ATG5-203ENST00000369070 3088 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.441e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-207ENST00000554927 561 ntTSL 212.21□□□□□ -0.451e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 412.07□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 IFRD2-215ENST00000492387 627 ntTSL 212.02□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 HCN3-202ENST00000467204 957 ntTSL 511.57□□□□□ -0.561e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 IFRD2-213ENST00000486322 524 ntTSL 311.29□□□□□ -0.61e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 RGS3-227ENST00000496113 641 ntTSL 411.28□□□□□ -0.61e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 RGS3-228ENST00000496264 457 ntTSL 511.08□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SNRPE-203ENST00000469451 248 ntTSL 311.03□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-204ENST00000554116 542 ntTSL 410.7□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 KIF2C-207ENST00000480574 783 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEH1L-209ENST00000592170 787 ntTSL 510.51□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 49.84□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 KIF2C-205ENST00000455186 908 ntTSL 59.3□□□□□ -0.921e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 RGS3-217ENST00000470775 364 ntTSL 58.75□□□□□ -1.011e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 DNAJA1-203ENST00000495015 604 ntTSL 37.44□□□□□ -1.221e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SGK494-204ENST00000494272 829 ntTSL 35.9□□□□□ -1.461e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 NUP35-210ENST00000497330 544 ntTSL 54.77□□□□□ -1.651e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 NUP35-204ENST00000442895 616 ntTSL 44.44□□□□□ -1.71e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 NUP35-206ENST00000452137 755 ntTSL 53.71□□□□□ -1.821e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 NUP35-207ENST00000455063 342 ntTSL 52.8□□□□□ -1.961e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.031e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 NUP35-205ENST00000446612 470 ntTSL 32.07□□□□□ -2.081e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEMA3F-207ENST00000450338 1693 ntTSL 522.36■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FAM131A-206ENST00000433578 573 ntTSL 516.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEMA3F-203ENST00000414301 936 ntTSL 514.97□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEMA3F-204ENST00000420831 442 ntTSL 57.9□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 39.2
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EFTUD2Q15029 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.685e-19■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-19■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.365e-19■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ANKRD10-203ENST00000460846 535 ntTSL 312.01□□□□□ -0.495e-19■■■■■ 39.2
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EFTUD2Q15029 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CDIP1-212ENST00000588381 484 ntTSL 316.43■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 39.2
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EFTUD2Q15029 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 IPO11-205ENST00000424533 3005 ntTSL 27.62□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 IPO11-214ENST00000514647 584 ntTSL 26.5□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TNPO2-211ENST00000588484 545 ntTSL 310.15□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.169e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.049e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 515.14■□□□□ 0.019e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.099e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.259e-10■■■■■ 39.2
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EFTUD2Q15029 BUB1-203ENST00000420328 566 ntTSL 511.55□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 BUB1-201ENST00000302759 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.243e-9■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 BUB1-205ENST00000447014 551 ntTSL 46.38□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 BUB1-207ENST00000466333 2501 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.493e-9■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 219.63■□□□□ 0.732e-14■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 C1orf35-202ENST00000465199 588 ntTSL 521.59■■□□□ 1.056e-8■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FARSA-206ENST00000587981 521 ntTSL 216.85■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SETD6-210ENST00000468223 584 ntTSL 425.38■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 39.1
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EFTUD2Q15029 NUMA1-215ENST00000537930 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.97□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 NUMA1-227ENST00000544129 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.71□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 NUMA1-228ENST00000544238 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.34□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 NUMA1-211ENST00000535947 576 ntAPPRIS ALT2 TSL 49.16□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 IFRD2-208ENST00000468737 606 ntTSL 414.36□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SLC26A6-222ENST00000496469 1034 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-12■■■■■ 39.1
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EFTUD2Q15029 HNRNPL-213ENST00000601664 447 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 HNRNPL-204ENST00000595443 2122 ntTSL 211.95□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 39.1
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