Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLK1P49759 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CLK1P49759 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLK1P49759 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLK1P49759 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLK1P49759 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLK1P49759 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLK1P49759 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms