Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPFP49454 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPFP49454 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms