Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms